Matej Zupan je profesor flaute na muzičkoj akademiji Univerziteta u Ljubljani. Od 1996. do 2008. godine bio je solo flautista Slovenačkog nacionalnog radio orkestra. Član je „Ariart“ duvačkog kvinteta, „Academia Ars Musicae“ kamernog orkestra, nedavno osnovanog Ansambla za novu muziku „MD7“, kao i Kamernog orkestra solista slovenačkog udruženja kompozitora. Intenzivno je nastupao u Sloveniji, Evropi, Severnoj i Južnoj Americi i u Aziji. Snimao je za slovenački Radio i Televiziju, RAI i Orf i snimio pet samostalnih CD ploča.